嗜肺军团菌(Legionella pneumophila)是一种典型的水传染病原菌，存在十自然水环境和人工水系统(给水系统、冷却水系统、医院、宾馆、疗养院、游泳池及温泉浴场)。自1976在美国的Philadelphia爆发军团病以来，水系统中的Legionella pneumophila也成为人们关注的焦点。有文献报导，Legionella pneumophila对氯的抵抗力很强，2-6mg/L的持续投氯量和20-50mg/L的周期性冲击加氯，才能抑制其在水中的繁殖，但如此高的加氯量势必会造成配水管道的严重腐蚀和DBPs的大量生成。加热也可以去除嗜肺军团菌，但作用是暂时的，经过一段时间后嗜肺军团菌会重新繁殖。
UV对嗜肺军团菌有较强的灭活能力。ZemingLiu等研究了UV对医院供水配水系统中Legionella pneumophila的灭活，发现试验之前对系统管道进行预处理(热水冲刷、加氯消毒)非常重要，而且UV消毒系统之前的过滤单元对维持UV强度的稳定也非常关键。Kumiko Oguma等人的研究表明，嗜肺军团菌具有相当强的光活化能力。