应用于泳池的消毒方法是多种多样的，可根据泳池的规格、使用人数的多少、对消毒效果要求高低及经济水平等因素，针对性地选择相应的消毒技术，目前公认的泳池水处理可以投放消毒药剂或者使用专业的泳池杀菌器。
以前大多数泳池会采取用消毒药剂的方法进行消毒，这种方法所需的成本也比较低。但是随着社会的发展，人们对于环保健康的意识越来越强烈，因此越来越多游泳馆会采用物理杀菌绿色消毒的方式。

目前市面上流行的泳池紫外线杀菌器，不锈钢紫外线杀菌除藻器，尤其是中压紫外线杀菌器，采用无化学的自动清洗系统，杀菌消毒效果快速高效，无需化学药剂的物理杀菌对人体无害，无需担心对人体产生的刺激伤害。目前很多泳池尤其是儿童泳池会采取这种消毒方案。