紫外线消毒工艺具有其他消毒工艺所无法比拟的优势，克服了现有传统消毒技能的缺陷。欧洲许多国家以及北美的加拿大和美国已在九十年代分离修改了环境立法，在废水处理后的消毒，以及饮用水的消毒上，推荐选用紫外线消毒技能。紫外线杀菌器的优势主要表现在：

　　(1)紫外线消毒技能具有较高的灭菌效率，运转安全可靠。紫外线消毒对细菌和病毒等具有较高的灭活效率而且因为不投加任何化学药剂，因而它不会对水体和周围环境发生二次污染。

　　(2)对隐孢子虫和贾第虫有特效消毒作用，惯例的氯消毒工艺对隐孢子虫和贾第虫的灭活作用很低，而且在较高的氯投量下会发生很多的消毒副产物，而紫外线消毒在较低的紫外线剂量下对隐孢子虫和贾第虫就可以达到较高的灭活作用。

　　(3)不发生有毒有害副产物，不增加饮用水的TOC含量。紫外线消毒不改变有机物的特性，而且因为不投加化学药剂，不会发生对人体有害的副产物，而且不会增加TOC和BOD等危害管网水生物稳定性的副产物。

　　(4)能降低臭味和降解微量有机物，紫外线对水中多种微量有机物具有必定的降解才能，而且能够降低水的臭和味。

　　(5)紫外线消毒设备占地面积小，运转保护简略、费用低。对每天5万吨污水用氯消毒来说，需建有一个130米长、3米宽的触摸渠。选用紫外线消毒只需20米长3米宽的面积；紫外线消毒运转保护简略，运转成本低，可达每吨水仅4厘人民币甚至更低，其性能价格比具有很大优势。

　　(6)消毒作用受水温、pH影响小。

　　紫外线消毒技能在工程应用中也存在必定的缺陷，主要有以下几个方面：

　　(1)无持续灭菌才能，消毒后的水如果遇到新的污染源，会再次被污染，需与氯配合运用；

　　(2)浊度及水中悬浮物对紫外灭菌有较大影响，降低消毒作用；

　　(3)紫外灯套管容易结垢，影响紫外光的透出和灭菌作用，因而需要对套管进行定期的清洗以及采纳外表降温办法来防止管垢的形成；

　　(4)细菌的复生现象，一些细菌被紫外照射失活的病毒细菌可通过光的协助修复自身被破坏的组织，达到复生意图，另外一些细菌可能存在着暗复生现象(无需光照)；

　　(5)国内运用经验少，在国内，尽管工程上现已逐渐开始运用紫外线系统，可是关于紫外线消毒技能的研讨并没有完全开展起来，关于紫外线消毒的应用也还存在较多问题。